Caractérisation génétique des atteintes hépatiques mitochondriales
Genetic characterization of mitochondrial liver damage
par Beinat Marine sous la direction de Rötig Agnès
Thèse de doctorat en Génétique
École doctorale Génétique, cellulaire, immunologie, infectiologie et développement

Soutenue le Monday 15 April 2013 à Université Paris Descartes ( Paris 5 )

Sujets
  • Ciblage d'un gène
  • Isolement des gènes
  • Manifestations métaboliques des maladies
  • Mitochondries -- Maladies

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Mots clés
Mitochondrie, Atteinte hépatique, Traduction mitochondriale
Resumé
Les maladies mitochondriales sont les anomalies congénitales du métabolisme les plus fréquentes. Elles sont caractérisées par une très grande hétérogénéité clinique et génétique, et le gène responsable de la maladie n'a pu être identifié que pour seulement 30% d'entre elles. Malgré l'hétérogénéité de ces maladies, il est possible d'identifier des groupes de patients cliniquement homogènes. C'est notamment le cas des atteintes hépatiques mitochondriales, qui peuvent se présenter sous une forme syndromique ou isolée. Les patients ayant une forme isolée ont soit une déplétion de l'ADNmt, soit une quantité d'ADNmt normale. Les patients avec déplétion de l'ADNmt sont très bien caractérisés génétiquement et sont mutés dans les gènes DGUOK, POLG, PEO1 ou MPV17, alors que les atteintes hépatiques sans déplétion de l'ADNmt n'ont commencé à l'être que plus récemment et montrent une très grande hétérogénéité génétique.Nous avons dans ce travail de recherche constitué une cohorte cliniquement homogène de 70 patients provenant des hôpitaux Necker-Enfants Malades et du Kremlin-Bicêtre présentant une atteinte hépatique mitochondriale isolée ou syndromique, sans déplétion de l'ADNmt, dont nous disposions de matériel (fibroblastes, ADN) nécessaire à leur étude. Nous avons tout d'abord identifié des mutations dans le gène TRMU, codant pour une enzyme de modification des ARNt mitochondriaux, responsables d'une anomalie de la traduction mitochondriale. Nous avons par ailleurs établi l'hétérogénéité génétique de ce groupe de patients, puisque nous avons pu exclure la présence de mutations dans les gènes TRMU, TSFM, GFM1 et LARS chez 40 patients, démontrant qu'il n'y a pas de gènes majeurs associé aux atteintes hépatiques sans déplétion de l'ADNmt. Pour deux familles multiplex pour lesquels l'ADN de plusieurs membres de la famille était disponible, nous avons réalisé une cartographie génétique combinée avec un séquençage exome et une étude du transcriptome, qui n'a pas permis de mettre en évidence de gène causal. Pour 38 autres patients, essentiellement des cas sporadiques, nous avons utilisé les stratégies du transcriptome et du séquençage exome, ce qui nous a permis d'identifier des variations robustes dans de nouveaux gènes MRPS5, ALDH1B, NOX5, MTUS1, AARS2, PPA2, MTHFD1, ALDH6A1, NME4 et GLDC pour 17 patients. Enfin, nous avons étudié particulièrement les mutations identifiées dans le gène NOX5, retrouvées chez 3 patients de la cohorte. Ce gène code pour une protéine NADPH de fonction inconnue, que pensons être impliquée dans la traduction mitochondriale.