Rôle des protéines APOL1 et APOL3 lors de l'infection par le virus Zika
Role of APOL1 and APOL3 during Zika virus infection
par Sarah LESAGE sous la direction de Nolwenn JOUVENET
Thèse de doctorat en Virologie
ED 562 Bio Sorbonne Paris Cité

Soutenue le lundi 19 octobre 2020 à Université Paris Cité

Sujets
  • Apolipoprotéine L1
  • Apolipoprotéines L
  • Récepteur interféron
  • Virus Zika

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Mots clés
Crible haut débit, APOL1, APOL3
Resumé
Lors d'une infection virale, la réponse immunitaire innée est rapidement induite. La reconnaissance des génomes viraux va déclencher des cascades de signalisation aboutissant à l'expression d'interféron de type I (IFN-I). Ainsi, plusieurs centaines de gènes stimulés par l'interféron (ISG) seront induits. L'approfondissement des connaissances sur le rôle des ISG lors d'infections virales est indispensable pour mieux comprendre la réponse immunitaire innée induite dans ce contexte et comment cette réponse peut être régulée ou contournée. Afin d'identifier des gènes impliqués dans la réponse immunitaire innée lors de l'infection par le virus Zika (ZIKV), nous avons réalisé un crible à haut débit à partir d'une banque d'ARN interférents (ARNi) permettant de cibler 386 gènes. Nous avons ainsi mis en évidence 21 gènes capables de moduler la réplication de ZIKV. Nous avons par la suite validé le rôle de 10 candidats par des méthodes de cytométrie en flux, de PCR quantitative et titration par plages de lyse. A la suite de ces analyses, la protéine APOL3 est apparue comme favorisant l'infection et nous avons choisi de nous focaliser sur la caractérisation des mécanismes sous-jacents à cet effet. Nous avons également inclus dans la suite de notre étude une protéine de la même famille, APOL1, qui semble avoir le même impact sur l'infection virale. Nous avons mis en évidence que le rôle de ces protéines sur l'infection par ZIKV n'est pas lié à leur rôle cellulaire dans la production de PI4P. Nous avons également observé que ces protéines ne favorisent pas uniquement la réplication de ZIKV mais celles d'autres flavivirus et de virus non apparentés, tel que le virus de la stomatite vésiculaire (VSV). Ces résultats laissent supposer un rôle large de ces candidats et non un effet virus-spécifique. Nous émettons l'hypothèse que les protéines APOL1 et APOL3 pourraient être des régulateurs négatifs de la voie Jak/STAT agissant directement ou indirectement sur la production d'ISGs. Bien que leurs fonctions restent à approfondir, notre étude a permis d'identifier des gènes de l'immunité ayant la capacité de moduler la réplication du virus ZIKV.