| Resumé |
L'Hétérogénéité cellulaire et les expressions génétiques fluctuantes dans un microenvironnement spécifique restent mal comprises. Ainsi, afin d'apporter un début de réponse à toutes ces questions, beaucoup de paradigmes scientifiques ont été développés, permettant de toujours repousser plus loin les limites du possible. Ainsi, l'objectif de ce premier projet de thèse fut de développer une méthode innovante pour l'analyse épigénétique multiplexée de cellules à une résolution cellulaire unique. En reliant la protéine transposon Tn5 à des anticorps ciblant des facteurs épigénétiques clés, il pourrait être possible d'identifier le site de liaison de facteurs de transcription spécifiques à l'échelle du génome. Néanmoins, en raison de la relative concurrence dans le développement d'une nouvelle technologie dans ce domaine, cet outil très prometteur fut breveté par une autre entreprise et ce projet de thèse a donc été interrompu au profit d'un autre projet dans cette même thématique. Ainsi, beaucoup de progrès importants en biologie sont fortement corrélés avec de nouvelles méthodologies toujours plus innovantes et qui permettent de définir le destin cellulaire au niveau moléculaire. Mais une grande majorité d'entre elles nécessite l'utilisation de procédures destructrices. Pour ces raisons, nous avons développé une nouvelle technologie permettant une analyse transcriptomique dans le temps sans aucune destruction cellulaire. Nommée TRACE pour l'analyse «TRanslatomique» par capture dans des vésicules extracellulaires, elle est caractérisée par l'expression d'un transgène fournissant une translation d'une partie représentative du transcriptome cellulaire à l'intérieur des vésicules extracellulaires. Ainsi, ce «translatome» des cellules qui expriment TRACE peut être suivi dans le temps de manière non destructrice in vitro et in vivo, ce qui est un outil puissant pour de nombreux domaines de recherches fondamentale et translationnelle |