Phytochemical investigation of Acronychia species using NMR and LC-MS based dereplication and metabolomics approaches
Etude phytochimique d'espèces du genre Acronychia en utilisant des approches de déréplication et métabolomique basées sur des techniques RMN et SM
par Kouloura Eirini sous la direction de Michel Sylvie et de Skaltsounis Alexios Léandros
Thèse de doctorat en Pharmacognosie
École doctorale Médicament, Toxicologie, Chimie, Imageries


Sujets
  • Acronychia
  • Analyse
  • Biotechnologie
  • Chimie végétale
  • Composition
  • Médicaments
  • Métabolomique

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Mots clés
Produits naturels, Acronychia, Rutaceae, Acétophénones de type Acronychia, Dimères de phloroglucinol, Chromatographie de partage centrifuge (FCPC), Rotamères, Enantiomères, Diastereomères, Chromatographie supercritique (SFC), Activité antibactérienne, Cytotoxicité, Activité anti-inflammatoire, Ionisation par électrospray (ESI), Spectrométrie de masse à plusieurs dimensions, Orbitrap, Métabolomique, Projection des spectres NMR 2D J-résolu (pJRES), Carbon-13 NMR, UPLC-ESI(±)-HRMS/MS, Analyse en composantes principales (ACP), Régression des moindres carrés partiels (PLS-r), Moindres carrés partiels orthogonaux (OPLS), Sparse PLS (sPLS)
Resumé
Les plantes médicinales constituent une source inexhaustible de composés (des produits naturels - PN) utilisé en médecine pour la prévention et le traitement de diverses maladies. L'introduction de nouvelles technologies et méthodes dans le domaine de la chimie des produits naturels a permis le développement de méthodes 'high throughput' pour la détermination de la composition chimique des extraits de plantes, l'évaluation de leurs propriétés et l'exploration de leur potentiel en tant que candidats médicaments. Dernièrement, la métabolomique, une approche intégrée incorporant les avantages des technologies d'analyse moderne et la puissance de la bioinformatique s'est révélé un outil efficace dans la biologie des systèmes. En particulier, l'application de la métabolomique pour la découverte de nouveaux composés bioactifs constitue un domaine émergent dans la chimie des produits naturels. Dans ce contexte, le genre Acronychia de la famille des Rutaceae a été choisi sur la base de son usage en médecine traditionnelle pour ses propriétés antimicrobienne, antipyrétique, antispasmodique et anti-inflammatoire. Nombre de méthodes chromatographiques modernes, spectrométriques et spectroscopiques sont utilisées pour l'exploration de leur contenu en métabolites suivant trois axes principaux constituant les trois chapitres de cette thèse. En bref, le premier chapitre décrit l'étude phytochimique d'Acronychia pedunculata, l'identification des métabolites secondaires contenus dans cette espèce et l'évaluation de leurs propriétés biologiques. Le deuxième chapitre vise au développement de méthodes analytiques pour l'identification des dimères d'acétophénones (marqueurs chimiotaxonomiques du genre) et aux stratégies utilisées pour la déréplication de ces différents extraits et la caractérisation chimique des composés par UHPLC-HRMSn. Le troisième chapitre se concentre sur l'application de méthodologies métabolomique (RMN et LC-MS) pour l'analyse comparative (entre les différentes espèces, origines, organes), pour des études chimiotaxonomiques (entre les espèces) et pour la corrélation des composés contenus avec une activité pharmacologique.