Pontage covalent, Spectrométrie de masse, Pathogènes, Facteurs de virulence, Protéines membranaires, Complexes protéiques

De nombreux agents pathogènes utilisent des facteurs de virulence qui leur permettent d'infecter les cellules humaines et d'échapper à la réponse immunitaire. Chez les bactéries, ces facteurs de virulence sont souvent des complexes protéiques membranaires de grande taille, ce qui les rend difficiles à étudier par des techniques traditionnelles de biologie structurale. Dans ce contexte, l'objectif de cette thèse était de développer de nouvelles méthodes basées le pontage covalent couplé à la spectrométrie de masse pour étudier la structure et les interactions de ces grands assemblages dans leur environnement natif. Les approches développées reposent sur l'utilisation d'agents pontants trifonctionnels innovants et de spectromètres de masse Orbitrap. Nous avons focalisé nos travaux sur deux pathogènes humains : Neisseria meningitidis et Leptospira. Pour Neisseria, nous nous sommes intéressés à sa nanomachinerie de piliation, qui est un facteur de virulence majeur. Nos résultats mettent en lumière de nouveaux partenaires d'interaction pour la sous-unité PilQ, ancrée dans la membrane externe, qui n'avaient jamais été décrits jusqu'à présents. Pour Leptospira, nos approches ont permis d'élucider l'architecture protéique complète de l'endoflagelle de la bactérie, élément essentiel pour sa motilité et sa virulence. D'une manière générale, cette thèse met en évidence tout l'intérêt des approches structurales basées sur la spectrométrie de masse pour la caractérisation fine d'assemblages protéiques bactériens dans leur environnement natif. Ces études peuvent permettre de mieux comprendre les mécanismes de virulence bactérienne et d'identifier de nouvelles cibles thérapeutiques pour lutter contre les infections.