Stratégies d'enrichissement au-delà de l'approche syndromique en réanimation : utilisation de modèles de regroupement non supervisés pour identifier les sous-types de syndromes de chocs aigus
Enrichment strategies beyond the syndromic approach in critical care : unsupervised model-based clustering to identify acute shock syndromes subtypes.
par Mohamed Sabri SOUSSI sous la direction de Étienne GAYAT et de Claudia DOS SANTOS
Thèse de doctorat en Génétique, omiques, bioinformatique et biologie des systèmes
ED 474 Frontières de l'Innovation en Recherche et Education

Soutenue le mardi 24 mai 2022 à Université Paris Cité

Sujets
  • Analyse de structure latente
  • Choc cardiogénique
  • Scores de dysfonction d'organes
  • Sepsis
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Mots clés
Sous-Types, Syndromes aigus, Sepsis, Choc cardiogénique, Défaillance d'organes, Mortalité, Regroupement, Analyse des classes latentes
Resumé
Les maladies critiques sont souvent définies de façon syndromique (sepsis, choc cardiogénique, insuffisance rénale aigue et syndrome de détresse respiratoire aiguë (SDRA)). Étant donné qu'un syndrome peut avoir des causes multiples, il n'est pas établi si tous les cas d'un syndrome aigu donné ont réellement la même maladie et nécessitent ainsi la même réponse thérapeutique et le même pronostic. En effet, les syndromes aigus en réanimation ont souvent de multiples causes possibles avec un large éventail physiopathologique et ont donc des cibles thérapeutiques potentielles différentes. Cette hétérogénéité soulève un problème majeur dans l'évaluation des innovations thérapeutiques dans ce domaine, car un traitement donné (corticoïdes, statines, stratégies de remplissage vasculaire) est évalué dans des syndromes aigus avec différents sous-types. Ceci pourrait expliquer les très nombreux résultats négatifs observés ces dernières années. Par conséquent, l'identification de sous-classes de patients qui peuvent être des " répondeurs au traitement " et la définition des caractéristiques cliniques et moléculaires qui soulignent la " réponse au traitement " peuvent non seulement fournir de nouvelles connaissances sur la physiopathologie des différents syndromes aigus, mais aussi ouvrir la voie au développement de nouveaux biomarqueurs (protéomique, transcriptomique, épigénomique) qui permettraient un enrichissement pronostique (identifier les patients à risque élevé de mauvais pronostic) et thérapeutique (identifier les patients dont le bénéfice sera plus probable pour un traitement donnée). Nous proposons ici d'utiliser des modèles de regroupement non supervisés (clustering) pour analyser les données cliniques et biologiques dans plusieurs cohortes prospectives européennes et nord-américaines afin d'identifier des sous-classes distinctes de patients avec des syndromes de chocs aigus (choc septique, choc cardiogénique), leurs signatures moléculaires (omiques) sous-jacentes, leur pronostic et leur réponse aux traitements nouvellement prescrits en réanimation.