Génétique, Téloméropathie, Monogénique, Somatique, SGR, Phénocopie, Fibrose pulmonaire idiopathique, NGS, PCR digitale

Les fibroses pulmonaires sont des maladies de cause variable, souvent inconnue, qui évoluent progressivement vers l'insuffisance respiratoire et le décès du patient. Dans 20% des cas, les fibroses ont un caractère familial faisant suspecter une cause génétique. Les gènes associés aux fibroses pulmonaires familiales de l'adulte sont principalement liés à la maintenance des télomères et au métabolisme du surfactant. Depuis le début des années 2000, de nombreux gènes ont progressivement été rapportés dans les téloméropathies dont les fibroses pulmonaires familiales ; à ce jour, une vingtaine de gènes sont explorés en routine dans les cas de suspicion génétique de fibrose pulmonaire idiopathique (FPI) chez l'adulte. Nous disposons d'une cohorte internationale (France, Grèce, Belgique, Irlande et autres) de fibroses pulmonaires familiales inexpliquées progressivement constituée depuis 2010 dans le département de génétique de l'hôpital Bichat. Il s'agit d'une cohorte « en croissance » exponentielle : actuellement, nous avons plus de 3000 prélèvements à visée génétique de cas index suspectés de FPI. Parmi eux, plus de 70 % restent à ce jour inexpliqués sur le plan génétique : aucun gène causal de la pathologie n'a été mis en évidence dans notre laboratoire et d'autres voies que la maintenance des télomères sont très certainement impliquées. Au total, 350 patients de 280 familles différentes ont pu bénéficier d'un séquençage d'exome afin d'explorer la majorité des gènes médicalement pertinents. En parallèle, nous avons recherché sur notre cohorte des marqueurs de téloméropathies par des approches moléculaires innovantes. Notre projet a consisté à identifier de nouveaux facteurs génétiques et à explorer de nouvelles voies mises en cause dans la FPI de l'adulte. Il a permis également d'apporter de nouvelles connaissances sur la biologie des téloméropathies.