Hijacking of cullin4-based E3 ligases confers non-proteolytic ubiquitination of influenza A virus PB2 protein
Le détournement d'ubiquitine ligases à culine 4 par la protéine PB2 des virus influenza A conduit à son ubiquitination non protéolytique
par Marwah KARIM sous la direction de Caroline DEMERET
Thèse de doctorat en Aspects moléculaires et cellulaires de la biologie. Microbiologie
ED 562 Bio Sorbonne Paris Cité

Soutenue le vendredi 22 novembre 2019 à Université Paris Cité

Sujets
  • Influenzavirus A
  • Protéine C de réplication
  • Spectroscopie de masse
  • Ubiquitin-protein ligases

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Mots clés
E3 ligase à culline 4
Resumé
Le système ubiquitine protéasome (UPS), régule un grand nombre de processus cellulaires, en catalysant l'ubiquitination des protéines. Les virus exploitent l'UPS pour favoriser l'infection, et échapper à la réponse immunitaire de l'hôte. Nous nous sommes concentrés sur l'interaction entre la protéine PB2 de la polymérase du virus de l'influenza A (IAV) et des enzymes E3 ubiquitine ligases à cullin 4 (CRL4), en particulier les facteurs les protéines DDB1, DCAF11 et DCAF12L1 les composant. Nous avons montré que deux CRL4s sont des régulateurs positifs de l'infection virale, et qu'ils catalysent l'ubiquitination de la protéine PB2 pendant l'infection. Cette ubiquitination, constituée par des chaînes poly-ubiquitine K29, n'induit pas la dégradation de PB2. Les CRL4s peuvent interagir avec PB2 lorsqu'elle est engagée dans le complexe de polymérase virale, mais n'affectent ni la transcription ni la réplication des segments viraux. Les CRL4 catalysent l'ubiquitination de différentes lysines sur PB2, qui pourraient supporter des fonctions distinctes de PB2. Nos travaux fournissent la première caractérisation d'une PTM non protéolytique de PB2, qui semble être nécessaire à l'infection optimale par les IAV. De plus, en utilisant la purification par affinité suivie d'une spectrométrie de masse (AP/MS), nous avons identifié des ensembles distincts de facteurs cellulaires se liant aux CRL4s pendant l'infection. Ces résultats pointent vers une modification du protéome cellulaire ciblé par ces CRL4 E3 ligases pro-virales pendant l'infection par les IAV.