| Resumé |
Le phénotype des protéines est caractérisé par certaines propriétés fonctionnelles, telles que l'affinité et la spécificité pour une cible donnée dans le cas des anticorps. Cependant, comprendre comment sont reliées ces propriétés demeure un défi. De manière à y répondre, il s'agit de mettre au point une méthode visant, en particulier, à mesurer la spécificité. Ici, nous proposons un procédé expérimental in vitro ainsi qu'une approche statistique permettant une quantification systématique de la spécificité des protéines. Nous avons mis au point une banque de molécules d'ADN (utilisées comme cibles) que nous avons sélectionnée par SELEX contre un ensemble d'anticorps recombinants (dont la structure est issue d'anticorps naturels). Nous proposons une métrique de la spécificité globale (en estimant l'affinité moyenne des anticorps pour la banque d'ADN) ainsi que de la spécificité locale (en mesurant la diversité des séquences d'ADN sélectionnées par les anticorps). Nous avons par ailleurs optimisé le protocole de sélection dans le but d'obtenir une quantification robuste et à haut-débit de l'affinité et de la spécificité. Ces résultats ouvrent la voie vers une étude systématique de la relation entre affinité et spécificité. |