Identification de marqueurs génétiques et épigénétiques de suivi des patient.es atteint.es de troubles du comportement alimentaire
Identification of genetic and epigenetic markers for monitoring patients with eating disorders
par Camille Odile Georgette VEREBI sous la direction de Thierry BIENVENU
Thèse de doctorat en Génétique
ED 562 Bio Sorbonne Paris Cité

Soutenue le jeudi 14 novembre 2024 à Université Paris Cité

Sujets
  • Épigénétique
  • Marqueurs biologiques
  • Troubles du comportement alimentaire

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Mots clés
Troubles du comportement alimentaire, Psychiatrie, Biomarqueur, Transcriptomique, Épigénétique, Biopsie liquide, ADN libre circulant
Resumé
Les troubles du comportement alimentaire (TCA) et particulièrement l'anorexie mentale (anorexia nervosa, AN) présentent un fort taux de rechute (>50%), une des mortalités les plus élevées de tous les troubles psychiatriques et de nombreuses comorbidités et représentent des challenges dans la prise en charge des patient.es. Il n'existe à ce jour aucun traitement pharmacologique pour la prise en charge thérapeutique des TCA. De plus, en dehors de la restauration pondérale, il n'existe à ce jour aucun marqueur biologique de la rémission alors même que les rechutes sont fréquentes et souvent précoces et la mortalité, la plus élevée parmi tous les troubles psychiatriques. Identifier de tels marqueurs peut être considéré comme une priorité des recherches portant sur les TCA. L'ensemble des travaux de cette thèse devrait permettre d'identifier des biomarqueurs permettant un meilleur suivi des patient.es. Les objectifs étant l'identification de biomarqueurs de rémission :avec l'identification de biomarqueurs d'expression géniques de comorbidité suicidaire et l'exploration de la physiopathologie de l'ADN libre circulant (ADNlc), mais également l'identification de biomarqueurs d'expression génique de rémission. Nous avons réalisé le RNA sequencing de 15 patientes atteintes de TCA présentant ou non des antécédents de tentative de suicide. Nous avons identifié plusieurs gènes dérégulés précédemment associés aux troubles de l'humeur, aux troubles dépressifs et au suicide. Nous avons observé un enrichissement dans les voies de l'immunité, de la dégranulation des neutrophiles, du TGFβ et du rythme circadien en rapport avec les comportements suicidaires dans l'AN. Après correction des tests multiples, nous avons identifié plusieurs gènes dysrégulés, tels que SNORD3C, précédemment impliqués dans le métabolisme de la vitamine D. Ce résultat a été confirmé dans une cohorte indépendante de 34 patientes atteintes d'AN. Les résultats de cette étude peuvent contribuer à une meilleure compréhension de la pathogenèse du comportement suicidaire dans l'AN et fournir des biomarqueurs potentiels, tels que SNORD3C, pour prédire le comportement suicidaire. Les concepts de biopsies liquides sont basés sur l'analyse de l'ADNlc dans le plasma et offrent des informations diagnostiques qui peuvent être, ou non, accessibles de manière conventionnelle par des biopsies invasives. L'analyse quantitative de ce type de marqueur a été réalisée sur l'ADN d'origine nucléaire et mitochondriale sur une cohorte de 98 patientes présentant divers TCA en comparaison à une cohorte contrôle. Il n'y a pas de différences franches en terme quantitatif entre les patientes et les contrôles. En revanche, nous avons montré que le profil de fragmentation des patient·es atteint·es de TCA diffère de celui des contrôles, suggérant l'implication des empreintes de nucléosomes, mettant potentiellement en évidence une contribution tissulaire différente au pool d'ADNlc. Ceci suggère l'importance de l'exploration qualitative exhaustive de l'ADNlc (taille, motifs terminaux, méthylation) et plus spécifiquement une étude ciblée des fragments issus du cerveau. La compréhension de la biologie de l'ADNlc et des données transcriptomiques chez les patient·es atteint·es de TCA permettra de mieux comprendre la physiopathologie, d'établir des biomarqueurs fiables de pronostic, et pourrait conduire à l'identification de nouvelles cibles thérapeutiques.