SARS-CoV-2, Réponse humorale, Covid-19, CXCL13, Cellule B, Cellule T

La lymphopénie due à l'apoptose des cellules T est une caractéristique de l'infection par le SARS-CoV-2. Comme la quantité et la qualité de la production d'immunoglobulines (Ig) sont modulées par un sous-ensemble de cellules T CD4+ (cellules T auxiliaires folliculaires, ou Tfh), nous avons pensé qu'une déplétion des cellules T CD4+ pourrait affecter la réponse humorale au SARS-CoV-2. Dans ce contexte, l'interaction des Tfh avec les cellules B permet de générer une réponse humorale efficace avec des Igs de haute avidité. La cytokine CXCL13 est un biomarqueur de l'activité du centre germinal (CG) dans les follicules de cellules B et reflète cette interaction. L'objectif de ma thèse était d'évaluer la réponse humorale dans le contexte de l'infection et de la vaccination par le SARS-CoV-2. J'ai déterminé la quantité d'IgA, d'IgM et d'IgG contre les protéines Nucleocapsid (N) et Spike (S) du SARS-CoV-2 chez les patients en unité de soins intensifs ("ICU") ou non. J'ai ensuite évalué la qualité des Ig à l'aide d'un protocole de mesure de l'indice d'avidité. On a démontré une réponse IgA prédominante contre N et un retard dans la réponse IgG contre N et S. La qualité de l'IgG était plus faible chez les patients ICU. Nous avons également démontré que le % de cellules T CD4 apoptotiques est inversement corrélé à la réponse IgG spécifique et positivement corrélé à CXCL10, un marqueur associé à la sévérité de la maladie. Ces résultats suggèrent qu'une déplétion précoce des cellules T est associée à une réponse humorale plus faible qui peut contribuer à la gravité de la maladie (y compris le décès) chez les personnes infectées par le SARS-CoV-2. Nous avons ensuite évalué la quantité et la qualité des Ig produites dans le contexte de la vaccination contre le SARS-CoV-2. Les réponses IgG et IgA ont été analysées chez les personnes ayant reçu deux ou trois doses de vaccins ARNm. En outre, nous avons examiné la réactivité croisée de ces anticorps contre les variantes du SARS-CoV-2 à l'aide d'un test de cytométrie de flux. Nous avons démontré que, par rapport aux personnes précédemment infectées et vaccinées, trois doses de vaccins ARNm étaient nécessaires pour générer des niveaux similaires d'IgG. La capacité des IgG à reconnaître les protéines S des variants viraux exprimés à la surface des cellules transfectées a été significativement améliorée par la vaccination répétée. Enfin, nous avons observé de faibles niveaux de CXCL13 chez les vaccinés après deux et trois doses, par rapport aux personnes infectées. Nos résultats démontrent que des vaccinations répétées sont nécessaires pour maintenir des niveaux élevés d'IgG. L'absence de détection de CXCL13 peut potentiellement expliquer la courte durée et la faible qualité des IgG induites. Nous avons également évalué la réponse humorale chez les individus souffrant de séquelles post-aiguës de COVID-19 (PASC). La réponse a été analysée à la fois chez des individus convalescents atteints de PASC et chez des individus convalescents asymptomatiques. Nous avons constaté qu'après 6 mois d'infection, les niveaux d'IgA spécifiques dirigées contre les protéines N et S étaient plus élevés chez les individus atteints de PACS que chez les convalescents asymptomatiques. La présence d'IgA dans le PACS était associée à des niveaux plus élevés d'interférons de type III produits par les cellules gastro-intestinales et à une dysrégulation des cellules T CD8 des muqueuses, déterminée par l'expression de l'intégrine B7. Ces résultats suggèrent que l'exposition persistante des cellules immunitaires aux antigènes viraux (N et S), dans les tissus des muqueuses, est associée au PASC. Mon PhD démontre l'importance de la quantité et de la qualité des IgG produites en tant que témoins de la réponse humorale au cours de maladies infectieuses. En outre, mes résultats soulignent l'importance de générer une réponse immunitaire efficace précoce ou par le biais de vaccinations répétées pour contrôler l'infection virale.