Characterization of secondary metabolites in the filamentous fungus Podospora anserina : for a better understanding of fungal physiology and the isolation of new bioactive metabolites
Caractérisation des métabolites secondaires dans le champignon filamenteux Podospora anserina : pour une meilleure compréhension de la physiologie fongique et l'isolement de nouveaux métabolites bioactifs
par Huijuan WANG sous la direction de Florence CHAPELAND-LECLERC et de Gwenaël RUPRICH-ROBERT
Thèse de doctorat en Microbiologie
ED 563 Médicament, Toxicologie, Chimie, Imageries

Soutenue le jeudi 23 novembre 2023 à Université Paris Cité

Sujets
  • Métabolites
  • Métabolites fongiques
  • Podospora anserina

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Mots clés
Podospora anserina, Métabolite secondaire, Groupes de gènes biosynthétiques, LaeA, CreA, HapX
Resumé
Les champignons ont une capacité remarquable à produire une gamme variée de métabolites secondaires (MS) avec des bioactivités potentielles. Ces métabolites secondaires ont des fonctions diverses, notamment la protection contre le stress UV, l'influence sur le développement et l'aide à la pénétration et à l'infection de l'hôte. Chez les champignons, les gènes produisant des MS sont généralement organisés en groupes identifiables appelés clusters, bien que beaucoup restent inactifs dans les conditions de laboratoire. Notre recherche se concentre spécifiquement sur la production de MS chez Podospora anserina, une espèce connue pour ses MS essentiels de faible poids moléculaire impliqués dans divers processus biologiques. La régulation de la production de MS chez les champignons implique des mécanismes transcriptionnels, épigénétiques et des stimuli environnementaux, avec des régulateurs importants tels que NsdD, LaeA, CreA et HapX. P. anserina possède 42 clusters putatifs de MS, dont 17 clusters de polykétide synthase (PKS) et 6 clusters de peptide synthétase non ribosomique (NRPS), etc. Malgré cela, peu de recherches ont exploré les rôles des MS tout au long de son cycle de vie. Pour combler cette lacune, notre approche consiste à réaliser la caractérisation fonctionnelle de NsdD, LaeA, CreA et HapX. En générant des mutants, nos objectifs étaient d'analyser leurs caractéristiques phénotypiques et d'effectuer l'identification de la structure de certains composés, dans le but de découvrir la signification fonctionnelle des métabolites secondaires chez P. anserina. L'étude de régulateurs globaux tels que PaNsdD et PaLaeA a amélioré notre compréhension de la production de métabolites secondaires. Le lancement des études de PaHapX et de PaCreA a révélé des variations phénotypiques préliminaires, notamment dans la réponse au stress et l'utilisation du carbone. Finalement, notre recherche vise à élucider la régulation complexe de la production de SMs fongiques et ses implications dans divers processus biologiques.