Base editing approaches for the treatment of β-hemoglobinopathies
Approches d'édition de base pour le traitement des β-hémoglobinopathies
par Panagiotis ANTONIOU sous la direction de Annarita MICCIO
Thèse de doctorat en Biologie cellulaire et moléculaire
ED 562 Bio Sorbonne Paris Cité

Soutenue le jeudi 02 décembre 2021 à Université Paris Cité

Sujets
  • Drépanocytose
  • Hémoglobinopathie
  • Thalassémie
  • Thérapie génique

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Mots clés
Édition de base, Βeta-hémoglobinopathies, Thérapie génique, Drépanocytose, Beta-thalassémie, HPFH, BCL11A enhancer
Resumé
Les beta-hémoglobinopathies sont dues à des mutations affectant la synthèse ou la structure de l'hémoglobine (Hb) adulte. La transplantation de cellules souches hématopoïétiques (CSH) autologues et génétiquement modifiées est une option thérapeutique intéressante pour les patients qui n'ont pas de donneur de CSH compatible. La gravité clinique des beta-hémoglobinopathies est atténuée par la présence de mutations provoquant l'expression de l'hémoglobine fœtale (HbF) dans la vie adulte - une condition appelée persistance héréditaire de l'HbF (HPFH). Pour réactiver l'expression de l'HbF, des approches d'édition du génome basées sur des nucléases spécifiques ont été explorées. Cependant, les nucléases spécifiques génèrent des cassures double brin (DSB) dans le génome et soulèvent des problèmes de sécurité pour les applications cliniques, en particulier lorsqu'elles sont utilisées dans des CSH sensibles aux DSB. L'édition de base est une technologie d'édition du génome basée sur CRISPR-Cas9 qui permet l'introduction de mutations ponctuelles (C>T par la cytidine désaminase ou CBE et A>G par l'adénine désaminase ou ABE) dans l'ADN sans générer de DSB. Les mutations HPFH dans les 2 promoteurs de la globine fœtale génèrent des sites de liaison pour les activateurs de l'HbF (par exemple KLF1, TAL1 et GATA1) ou perturbent les sites de liaison des répresseurs de l'HbF (par exemple LRF et BCL11A). De même, les SNP situés dans l'enhancer de BCL11A régulent négativement l'expression de BCL11A, un répresseur majeur de la synthèse de l'HbF. L'objectif de cette thèse de doctorat est d'utiliser l'édition de base pour cibler des séquences d'ADN spécifiques dans les promoteurs HBG et l'enhancer de BCL11A afin d'imiter l'effet des mutations HPFH.