| Resumé |
Les éléments transposables (ETs) sont des séquences d'ADN mobiles qui ont la propriété remarquable de se déplacer et se propager dans les génomes. Découverts dans les années 1940 chez le maïs, ils sont présents dans tous les génomes séquencés à ce jour. Bien que le nombre d'études décrivant leur rôle dans l'évolution, la fonction et la structure des génomes n'a cessé d'augmenter depuis, nous sommes encore loin de comprendre toute l'étendue de l'impact biologique des ETs sur les organismes. La distribution des ETs n'est pas aléatoire, phénomène dû en partie aux mécanismes qui orientent l'intégration vers des régions préférentielles du génome. C'est le cas du rétrotransposon Ty1 de la levure S. cerevisiae, qui s'intègre principalement dans une fenêtre d'une kilobase en amont des gènes transcrits par l'ARN polymérase III (Pol III). Cette spécificité résulte d'une interaction entre l'intégrase codée par l'élément et une sous-unité de la Pol III, AC40. En son absence, Ty1 cible préférentiellement les subtélomères, ce qui suggère l'existence d'autres facteurs régulant la sélectivité d'intégration du rétrotransposon. Ce travail a eu pour but d'identifier ces facteurs par deux approches complémentaires. D'une part, nous avons étudié le rôle des marques d'histones corrélant avec les insertions de Ty1 dans le choix du site d'intégration. D'autre part, nous avons recherché de nouveaux partenaires de l'intégrase de Ty1 par une approche protéomique à grande échelle. Si nos résultats n'ont pas permis d'identifier de nouveaux facteurs cellulaires impliqués dans la reconnaissance du site d'intégration de Ty1, ils ont élargi le répertoire des protéines de l'hôte qui régulent la rétrotransposition de Ty1. En effet, nous avons découvert que le variant d'histone H2A.Z et la protéine kinase CK2 répriment la rétrotransposition de Ty1. CK2 agit aux étapes transcriptionnelle et post-transcriptionnelle, interagit avec l'intégrase in vivo et la phosphoryle in vitro sur plusieurs résidus dans le domaine C-terminal, régulant probablement ainsi sa stabilité. Des expériences supplémentaires seront nécessaires pour confirmer cette hypothèse, découvrir par quel mécanisme CK2 régule Ty1, et comprendre le rôle de H2A.Z. |